吉布提目前已经有两个自贸区。吉布提的首个自贸区位于吉布提港内，第二个自贸区规模较大，成立于2004年，占地21公顷，位于吉布提港和德拉尔集装箱码头之间，被称为“吉布提自贸区（DFZ）”。自贸区内员工人数超过1000人，主要从事轻工产品制造、物流重分配和普通贸易行业。新规划建设的吉布提自贸区（DFTZ）规划面积为48.2平方公里，其中首发区面积为2.4平方公里，主要包括商贸物流园区和出口加工区。　
       吉布提国际自由贸易区的贸易自由和运输自由，将引导商贸物流向多元化的方向发展。自贸区的建设对贸易的促进需要下游企业的推动，这将有利于海运、空运、快递、仓储等业务量的增加。自贸区打破贸易屏障后，零关税的实施、通关制度和手续的简化，将极大促进各类型贸易活动，而金融领域的开放将促成自贸区自由的商业环境，增强对国内外企业经营投资的吸引力。自贸区对于物流的集聚效应尤其显著，伴随吉布提和埃塞俄比亚的经济发展，免税和自由港将有利于吸引高端制造加工业和商贸物流业，从而带来更多的物流货源，有利于进一步巩固吉布提门户港口和海铁联运运枢纽港地位。吉布提国际自由贸易区辐射范围将进一步扩大，惠及东非大区域，使吉布提国际自由贸易区真正成为东非贸易和物流枢纽的平台。
       吉布提国际自由贸易区商贸物流园区将在现有仓储物流业务的基础上，进一步完善和扩大保税物流（拆拼箱、多国集拼、进口分拨、转口仓储及其他物流服务等），建设区域商品集散中心、区域分拨中心、商品展览展销中心，开拓物流加工等增值服务。上述业务的增量是一个循序渐进的长期过程和市场培育过程。 目前，中国在吉布提中资企业已近20家，还有十几家意向企业进驻。目前中方企业承包或参与的合作项目主要有：吉埃铁路吉布提段项目，吉埃引水项目，盐业码头建设项目，新多功能码头项目，塔朱拉港口项目，自贸区开发项目等。2015年3月驻吉布提中资企业商会成立。