吉布提国际自由贸易区由吉布提国际工业园区运营有限公司进行运营和管理。在商贸物流园区、出口加工区、多用途码头、集装箱码头和中央商业区等板块区域内，为进驻园区企业提供相关服，对于国内的投资企业的服务需求主要有以下几个方面。
       （一）信息咨询服务
       1．政策咨询。为进入吉布提国际自由贸易区和商贸物流园区内投资创业的企业搭建与吉布提政府部门和有关机构沟通、协调的平台，提供投资、贸易、税收、金融、产业等政策咨询。
       2．法律服务。为进入吉布提国际自由贸易区和商贸物流园区企业提供吉布提与投资相关的法律咨询服务，帮助入区企业了解吉布提基本法律，熟悉投资环境，寻找和委托相应的法律服务中介机构。
       3．产品推介。协助入吉布提国际自由贸易区和商贸物流园区企业参加吉布提举办的展览会及各类会议活动、行业产品对接会、贸易洽谈会等，为企业搭建合作平台，推介入区企业生产的产品，并为其寻找产品代理商或经销商。
       （二）运营管理服务
       1．企业注册。建立与吉布提外资管理部门或投资促进机构的沟通和联系机制，为入吉布提国际自由贸易区和商贸物流园区的企业提供在吉布提注册登记的相关咨询服务，协助入区企业办理注册登记、投资项目环境影响评估和规划设计审批等相关手续。
       2．财税事务。为入吉布提国际自由贸易区和商贸物流园区企业提供吉布提相关财务和税收方面的政策咨询，并协助入区企业在财务管理、商标注册、税收申报和缴纳等方面的工作。
       3．海关申报。为入吉布提国际自由贸易区和商贸物流园区企业提供吉布提关于海关申报、进口报关、仓储运输、进出口手续、原产地证明及关税申报等相关咨询服务。
       4．人力资源。为入吉布提国际自由贸易区和商贸物流园区企业提供吉布提关于员工管理、人员签证等政策咨询服务，并协助入区企业相关人员办理签证、举办员工培训、人员招聘、人才交流等人力资源方面的事务，帮助招聘本地员工，代办中国员工的邀请、签证等。
       5．金融服务。为入吉布提国际自由贸易区和商贸物流园区企业提供投融资、保险等金融咨询服务，协助企业办理相关金融手续，建立入区企业和国内外金融机构联系的渠道。
       6．物流服务。可根据入吉布提国际自由贸易区和商贸物流园区企业的要求，提供必要的物流服务，包括运输、仓储、装卸、搬运、配送、信息处理等。